"Esta mañana, di positivo por covid-19. Me siento bien, y continuaré trabajando de forma remota esta semana mientras sigo las pautas de salud pública", escribió el primer ministro en su cuenta de Twitter.
También instó a los canadienses a vacunarse.
Trudeau recibió recientemente su tercera dosis de vacunas contra el coronavirus.
El primer ministro también estuvo aislado en su casa al inicio de la pandemia, cuando su esposa dio positivo.
Canadá tiene una de las tasas de vacunación más altas del mundo. Las inyecciones por lo general evitan contagios y hacen que los que se enferman de covid tengan síntomas más leves.
El anuncio ocurre después de un fin de semana en que proliferaron las protestas en Ottawa, la capital canadiense, contra las medidas sanitarias implementadas para combatir el virus.
Algunos de los manifestantes vinieron en caravanas de camiones y se estacionaron en las calles aledañas a la sede del Parlamento, trancando el tránsito.